【朗報】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別

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1: 田杉山脈 ★ 2020/07/06(月) 21:50:34.92 ID:CAP_USER

理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。

奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。

さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html

25: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:11:34.21 ID:bS9f5ADD
>>1
富岳って対コロナ用に前倒しで実戦配備されたんだよな
ガンダムみたいだな ガンガレ!

 

32: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:15:01.64 ID:5WqN0ntI
>>25
富岳「待たせたな」

 

33: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:16:30.13 ID:bS9f5ADD
>>32
京が1年掛かる計算を数日でできるらしいからな
21年始動を1年近く前倒ししたとか浪漫すぎる

 

106: 名刺は切らしておりまして 2020/07/07(火) 00:14:18.05 ID:avQJvaRw
>>32
かっこいい

 

46: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:31:55.84 ID:3QG/wvVV
>>1
俺なら2000どころか、もっと挙げてみせるぜ
10倍くらいいけるな

 

50: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:36:01.50 ID:JRgHFmVx
>>46
そこから可能性ありと抽出されたのは数十種

 

70: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:59:13.79 ID:IOGq2IuB
>>1
俺なら何億種類でも候補に出来るぞ、スパコン超えたな。

 

79: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 23:11:36.66 ID:ogllZW85
>>1
富岳の開発費用は1100億円だろう?、
きっと2000億円くらいで売れるよ

 

3: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 21:51:23.11 ID:cpKvbWaA
俺にも使わせてくれ
ソシャゲが快適にプレイできるか試したい

 

8: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:03:12.11 ID:7IYd1u14
>>3
意外と出来ないと思うぞ

 

41: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:25:32.34 ID:4mMaDjNE
>>3
富岳の計算能力は大体スマホ3000万台分

 

4: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 21:55:07.61 ID:/0qWIPOR
さすがARMの高性能CPUはすごいな
6: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:00:31.25 ID:nFc+VITg
今は分子動力学計算でそんなことまで解るようになったんだな

 

7: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:03:02.54 ID:1AH0K0iO
ちなみに、富岳の最寄り駅は「京コンピュータ前駅」だぜ
京はもう無いけど、駅名を変えるにはスゲー金かかるから、当分このままらしい

 

81: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 23:12:37.77 ID:uk+io0c6
>>7
あの辺は製薬会社の研究所がいっぱいあったね

 

9: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:04:54.71 ID:jORb0OlU
分子動力学計算はgrapeの方が計算速いはずだけど、ARMベースのほうがプログラム構築が汎用的で使いやすいのかな。

 

55: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:42:37.41 ID:KqiHOmUJ
>>9
grapeは専用命令を追加したプロセッサだったような。ただ並列度はわからん。
以前にEDAベンダーのセミナーで発表があった。いわゆる「当社のツールを使ってプロセッサを開発しました」っていう内容で。
もっとも、スパコンとなると並列度が全然違うからな。

 

40: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:25:01.23 ID:deOhSO6b
別に富岳じゃないとできないわけじゃないんじゃないの?

 

42: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:28:22.80 ID:Uz/qnD6W
>>40
i7のCPU一個でも可能だが何万年もかかるというわけ

 

87: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 23:20:25.94 ID:MR51hR02
>>40
別に富岳でなくてもできる
上場企業がすでに同じことしてるし
ただ処理能力高いから他よりもはやくできる

 

45: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:30:19.53 ID:ncbxTIVS

他国のスパコンだってその位やってるだろう

ぶっちぎりの1位でもないのに

 

47: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 22:32:28.55 ID:4mMaDjNE
>>45
今はぶっちぎりの一位
そして4種類のベンチマーク全てでの一位(4冠)は史上初

 

97: 名刺は切らしておりまして 2020/07/06(月) 23:44:47.42 ID:0nDwEj8L

すげーーーーーーーーーな

日本

 





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